Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
ISXQ2M1V0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms