Protein–RNA interactions for Protein: Q17R98

ZNF827, Zinc finger protein 827, humanhuman

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF827Q17R98 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF827Q17R98 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF827Q17R98 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms