Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DDR2Q16832 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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