Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HIF1AQ16665 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HIF1AQ16665 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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