Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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SGCBQ16585 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SGCBQ16585 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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