Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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GABRA6Q16445 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
GABRA6Q16445 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
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