Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK4Q16099 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms