Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZIC1Q15915 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms