Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SF3A1Q15459 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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