Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 NDUFC2-KCTD14-202ENST00000530054 656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
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R3HDM1Q15032 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
R3HDM1Q15032 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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