Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PSMD6Q15008 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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