Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RFTN1Q14699 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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