Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
EBI3Q14213 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms