Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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CKAP5Q14008 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CKAP5Q14008 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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