Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NAE1Q13564 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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