Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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