Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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PLD1Q13393 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms