Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SKP2Q13309 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SKP2Q13309 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SKP2Q13309 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SKP2Q13309 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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