Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SELENBP1Q13228 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SELENBP1Q13228 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms