Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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CALCOCO2Q13137 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CALCOCO2Q13137 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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CALCOCO2Q13137 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CALCOCO2Q13137 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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