Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GBE1Q04446 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms