Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RHDQ02161 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RHDQ02161 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RHDQ02161 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms