Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SLC6A3Q01959 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SLC6A3Q01959 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms