Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CLTCQ00610 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLTCQ00610 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms