Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIM1P81133 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIM1P81133 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SIM1P81133 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SIM1P81133 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SIM1P81133 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms