Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSNK2BP67870 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSNK2BP67870 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSNK2BP67870 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSNK2BP67870 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms