Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SNRPNP63162 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms