Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HERVK_113P62684 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms