Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
UFM1P61960 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFM1P61960 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFM1P61960 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFM1P61960 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
UFM1P61960 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms