Protein–RNA interactions for Protein: P55011

SLC12A2, Solute carrier family 12 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A2P55011 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SLC12A2P55011 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms