Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TAF6P49848 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TAF6P49848 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TAF6P49848 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms