Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RFX3P48380 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms