Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CRATP43155 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CRATP43155 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CRATP43155 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms