Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ACTR1BP42025 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms