Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
HOXD13P35453 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms