Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CTNNB1P35222 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms