Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CPS1P31327 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CPS1P31327 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CPS1P31327 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CPS1P31327 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms