Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
HOXA7P31268 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
HOXA7P31268 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms