Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ALDH4A1P30038 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ALDH4A1P30038 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms