Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SSFA2P28290 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms