Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PTPRBP23467 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRBP23467 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRBP23467 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRBP23467 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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PTPRBP23467 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PTPRBP23467 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRBP23467 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRBP23467 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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PTPRBP23467 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PTPRBP23467 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.05■□□□□ 0
PTPRBP23467 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.05■□□□□ 0
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