Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HRCP23327 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HRCP23327 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HRCP23327 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HRCP23327 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HRCP23327 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HRCP23327 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HRCP23327 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HRCP23327 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HRCP23327 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HRCP23327 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms