Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LHCGRP22888 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LHCGRP22888 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms