Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD247P20963 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD247P20963 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD247P20963 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms