Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRHP20396 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRHP20396 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRHP20396 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRHP20396 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC005786.4-201ENST00000623369 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRHP20396 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRHP20396 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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