Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
AMD1P17707 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AMD1P17707 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AMD1P17707 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms