Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HOXB9P17482 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms