Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GCFC2P16383 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms