Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LAMC1P11047 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms