Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLK3P07288 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
KLK3P07288 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLK3P07288 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms